Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM5

FETUB, Fetuin-B, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FETUBQ9UGM5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FETUBQ9UGM5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FETUBQ9UGM5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FETUBQ9UGM5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FETUBQ9UGM5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FETUBQ9UGM5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FETUBQ9UGM5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FETUBQ9UGM5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FETUBQ9UGM5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FETUBQ9UGM5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms