Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC6Q9UBN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC6Q9UBN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC6Q9UBN7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HDAC6Q9UBN7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HDAC6Q9UBN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDAC6Q9UBN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HDAC6Q9UBN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HDAC6Q9UBN7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC6Q9UBN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms