Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM9Q9P0T7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM9Q9P0T7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM9Q9P0T7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM9Q9P0T7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM9Q9P0T7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM9Q9P0T7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM9Q9P0T7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM9Q9P0T7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM9Q9P0T7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM9Q9P0T7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM9Q9P0T7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM9Q9P0T7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM9Q9P0T7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM9Q9P0T7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM9Q9P0T7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM9Q9P0T7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM9Q9P0T7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms