Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED11Q9P086 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED11Q9P086 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MED11Q9P086 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED11Q9P086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED11Q9P086 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED11Q9P086 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED11Q9P086 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED11Q9P086 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED11Q9P086 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED11Q9P086 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED11Q9P086 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED11Q9P086 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms