Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ3

GTSE1, G2 and S phase-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1Q9NYZ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTSE1Q9NYZ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTSE1Q9NYZ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTSE1Q9NYZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTSE1Q9NYZ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTSE1Q9NYZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTSE1Q9NYZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTSE1Q9NYZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTSE1Q9NYZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms