Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.31e-323■■■■■ 83.6
AATFQ9NY61 ABCA13-201ENST00000411975 4480 ntTSL 213.61□□□□□ -0.233e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 ABCA13-205ENST00000453246 4275 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 ABCA13-207ENST00000544596 7870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.983e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.563e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.321e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 82.1
AATFQ9NY61 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 427.89■■■□□ 2.062e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 80.4
AATFQ9NY61 MC1R-201ENST00000539976 2464 ntTSL 515.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 80.4
AATFQ9NY61 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 80.4
AATFQ9NY61 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 517.33■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 215.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 511.35□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 233.36■■■□□ 2.934e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 PITPNA-206ENST00000574991 627 ntTSL 36.96□□□□□ -1.34e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 425.03■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.39■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 322.94■■□□□ 1.264e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 221.9■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 418.59■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 418.59■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 77.6
AATFQ9NY61 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 75.6
AATFQ9NY61 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 75.6
AATFQ9NY61 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -14e-49■■■■■ 75.4
AATFQ9NY61 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 224.77■■□□□ 1.562e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 423.63■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 319.84■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 418.33■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 416.73■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 416.34■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 316.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 414.16□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 513.88□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-213ENST00000573659 578 ntTSL 411.77□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 411.25□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 47.73□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 74
AATFQ9NY61 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 235.59■■■■□ 3.292e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 235.59■■■■□ 3.292e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 432.38■■■□□ 2.772e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 532.37■■■□□ 2.772e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.062e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 223.5■■□□□ 1.352e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 223.21■■□□□ 1.312e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 521.12■□□□□ 0.972e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 416.08■□□□□ 0.162e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 73
AATFQ9NY61 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.97e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 519.55■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.467e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.357e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 415.91■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.417e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.68□□□□□ -1.54e-49■■■■■ 72.6
AATFQ9NY61 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.32□□□□□ -1.564e-49■■■■■ 72.6
AATFQ9NY61 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.322e-77■■■■■ 71.8
AATFQ9NY61 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 312.63□□□□□ -0.391e-323■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 49.7□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-13■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.712e-13■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.934e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-203ENST00000570676 1104 ntTSL 218.44■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-210ENST00000576148 343 ntTSL 38.89□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 511.6□□□□□ -0.551e-46■■■■■ 69.1
AATFQ9NY61 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 210.52□□□□□ -0.731e-46■■■■■ 69.1
AATFQ9NY61 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.82□□□□□ -0.841e-46■■■■■ 69.1
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 55.8 ms