Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.31e-323■■■■■ 83.6
AATFQ9NY61 ABCA13-201ENST00000411975 4480 ntTSL 213.61□□□□□ -0.233e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 ABCA13-205ENST00000453246 4275 ntTSL 211.16□□□□□ -0.623e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 ABCA13-207ENST00000544596 7870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.983e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.563e-12■■■■■ 83.4
AATFQ9NY61 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.321e-323■■■■■ 83.3
AATFQ9NY61 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 82.1
AATFQ9NY61 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 427.89■■■□□ 2.062e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 81.7
AATFQ9NY61 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 80.4
AATFQ9NY61 MC1R-201ENST00000539976 2464 ntTSL 515.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 80.4
AATFQ9NY61 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 80.4
AATFQ9NY61 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 517.33■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 215.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 511.35□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 80.3
AATFQ9NY61 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 233.36■■■□□ 2.934e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 PITPNA-206ENST00000574991 627 ntTSL 36.96□□□□□ -1.34e-9■■■■■ 80.2
AATFQ9NY61 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 425.03■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.39■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 322.94■■□□□ 1.264e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 221.9■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 418.59■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 78.2
AATFQ9NY61 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 418.59■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 77.6
AATFQ9NY61 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 75.6
AATFQ9NY61 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 75.6
AATFQ9NY61 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -14e-49■■■■■ 75.4
AATFQ9NY61 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 224.77■■□□□ 1.562e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 423.63■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 319.84■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 418.33■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 416.73■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 416.34■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 316.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 414.16□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 513.88□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-213ENST00000573659 578 ntTSL 411.77□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 411.25□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 47.73□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 74.6
AATFQ9NY61 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 74
AATFQ9NY61 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 235.59■■■■□ 3.292e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 235.59■■■■□ 3.292e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 432.38■■■□□ 2.772e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 532.37■■■□□ 2.772e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.062e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 223.5■■□□□ 1.352e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 223.21■■□□□ 1.312e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 521.12■□□□□ 0.972e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 416.08■□□□□ 0.162e-21■■■■■ 73.9
AATFQ9NY61 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 73
AATFQ9NY61 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.97e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 519.55■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.467e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.357e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 415.91■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.417e-8■■■■■ 73
AATFQ9NY61 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.68□□□□□ -1.54e-49■■■■■ 72.6
AATFQ9NY61 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.32□□□□□ -1.564e-49■■■■■ 72.6
AATFQ9NY61 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.322e-77■■■■■ 71.8
AATFQ9NY61 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 312.63□□□□□ -0.391e-323■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 49.7□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-13■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.712e-13■■■■■ 70.8
AATFQ9NY61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.934e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-203ENST00000570676 1104 ntTSL 218.44■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 RAB40B-210ENST00000576148 343 ntTSL 38.89□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 70.4
AATFQ9NY61 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 511.6□□□□□ -0.551e-46■■■■■ 69.1
AATFQ9NY61 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 210.52□□□□□ -0.731e-46■■■■■ 69.1
AATFQ9NY61 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.82□□□□□ -0.841e-46■■■■■ 69.1
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