RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555770.1

CKB-214, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 4

Gene CKB, Length 816 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-214ENST00000555770 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.85■■■■■ 8.29
CKB-214ENST00000555770 ABCC9O60706 1549 aa60.59■■■■■ 7.29
CKB-214ENST00000555770 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.15■■■■■ 7.22
CKB-214ENST00000555770 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.46■■■■■ 6.79
CKB-214ENST00000555770 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.28■■■■■ 6.76
CKB-214ENST00000555770 NACADO15069 1562 aa56.97■■■■■ 6.71
CKB-214ENST00000555770 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.52■■■■■ 6.64
CKB-214ENST00000555770 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.34■■■■■ 6.61
CKB-214ENST00000555770 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.17■■■■■ 6.58
CKB-214ENST00000555770 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.08■■■■■ 6.57
CKB-214ENST00000555770 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.87■■■■■ 6.53
CKB-214ENST00000555770 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.33■■■■■ 6.45
CKB-214ENST00000555770 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.21■■■■■ 6.43
CKB-214ENST00000555770 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.04■■■■■ 6.4
CKB-214ENST00000555770 SCRIBQ14160 1630 aa54.78■■■■■ 6.36
CKB-214ENST00000555770 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.72■■■■■ 6.35
CKB-214ENST00000555770 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.63■■■■■ 6.34
CKB-214ENST00000555770 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.51■■■■■ 6.32
CKB-214ENST00000555770 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.88■■■■■ 6.06
CKB-214ENST00000555770 NCAPD3P42695 1498 aa52.64■■■■■ 6.02
CKB-214ENST00000555770 CUX2O14529 1486 aa52.41■■■■■ 5.98
CKB-214ENST00000555770 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.41■■■■■ 5.98
CKB-214ENST00000555770 ERCC6Q03468 1493 aa52.31■■■■■ 5.96
CKB-214ENST00000555770 SMARCA4P51532 1647 aa52.23■■■■■ 5.95
CKB-214ENST00000555770 SMARCA2P51531 1590 aa52.21■■■■■ 5.95
CKB-214ENST00000555770 HMGXB3Q12766 1538 aa52.2■■■■■ 5.95
CKB-214ENST00000555770 NESP48681 1621 aa51.95■■■■■ 5.91
CKB-214ENST00000555770 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.9■■■■■ 5.9
CKB-214ENST00000555770 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
CKB-214ENST00000555770 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.75■■■■■ 5.88
CKB-214ENST00000555770 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.52■■■■■ 5.84
CKB-214ENST00000555770 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.52■■■■■ 5.84
CKB-214ENST00000555770 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.49■■■■■ 5.83
CKB-214ENST00000555770 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.23■■■■■ 5.79
CKB-214ENST00000555770 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.2■■■■■ 5.79
CKB-214ENST00000555770 CADPSQ9ULU8 1353 aa51■■■■■ 5.75
CKB-214ENST00000555770 WIZO95785 1651 aa50.86■■■■■ 5.73
CKB-214ENST00000555770 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.8■■■■■ 5.72
CKB-214ENST00000555770 WDR62O43379 1518 aa50.71■■■■■ 5.71
CKB-214ENST00000555770 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.5■■■■■ 5.67
CKB-214ENST00000555770 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.41■■■■■ 5.66
CKB-214ENST00000555770 CFTRP13569 1480 aa50.34■■■■■ 5.65
CKB-214ENST00000555770 TRIM41Q8WV44 630 aa50.32■■■■■ 5.65
CKB-214ENST00000555770 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.29■■■■■ 5.64
CKB-214ENST00000555770 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.62
CKB-214ENST00000555770 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
CKB-214ENST00000555770 OSCARQ8IYS5 282 aa49.91■■■■■ 5.58
CKB-214ENST00000555770 PRDM2Q13029 1718 aa49.74■■■■■ 5.55
CKB-214ENST00000555770 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.63■■■■■ 5.53
CKB-214ENST00000555770 IFT140Q96RY7 1462 aa49.51■■■■■ 5.52
CKB-214ENST00000555770 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.51■■■■■ 5.52
CKB-214ENST00000555770 TOPBP1Q92547 1522 aa49.42■■■■■ 5.5
CKB-214ENST00000555770 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.34■■■■■ 5.49
CKB-214ENST00000555770 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.34■■■■■ 5.49
CKB-214ENST00000555770 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.34■■■■■ 5.49
CKB-214ENST00000555770 ABCC8Q09428 1581 aa49.24■■■■■ 5.47
CKB-214ENST00000555770 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
CKB-214ENST00000555770 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.19■■■■■ 5.46
CKB-214ENST00000555770 ARHGEF11O15085 1522 aa49.15■■■■■ 5.46
CKB-214ENST00000555770 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
CKB-214ENST00000555770 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.99■■■■■ 5.433e-7■■■■■ 29.3
CKB-214ENST00000555770 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.9■■■■■ 5.42
CKB-214ENST00000555770 CHD1O14646 1710 aa48.89■■■■■ 5.42
CKB-214ENST00000555770 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.77■■■■■ 5.4
CKB-214ENST00000555770 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.72■■■■■ 5.39
CKB-214ENST00000555770 FBLN2P98095 1184 aa48.68■■■■■ 5.38
CKB-214ENST00000555770 ARAP1Q96P48 1450 aa48.66■■■■■ 5.38
CKB-214ENST00000555770 SOGA1O94964 1423 aa48.64■■■■■ 5.38
CKB-214ENST00000555770 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
CKB-214ENST00000555770 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.52■■■■■ 5.36
CKB-214ENST00000555770 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.48■■■■■ 5.35
CKB-214ENST00000555770 WDR97A6NE52 1622 aa48.47■■■■■ 5.35
CKB-214ENST00000555770 CUX1P39880 1505 aa48.42■■■■■ 5.34
CKB-214ENST00000555770 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.37■■■■■ 5.33
CKB-214ENST00000555770 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
CKB-214ENST00000555770 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
CKB-214ENST00000555770 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
CKB-214ENST00000555770 GRIN2BQ13224 1484 aa48.27■■■■■ 5.32
CKB-214ENST00000555770 SYNJ1O43426 1573 aa48.24■■■■■ 5.31
CKB-214ENST00000555770 SYNJ2O15056 1496 aa48.17■■■■■ 5.3
CKB-214ENST00000555770 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.04■■■■■ 5.28
CKB-214ENST00000555770 PBRM1Q86U86 1689 aa48.03■■■■■ 5.28
CKB-214ENST00000555770 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.95■■■■■ 5.27
CKB-214ENST00000555770 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.92■■■■■ 5.26
CKB-214ENST00000555770 GRIN2AQ12879 1464 aa47.66■■■■■ 5.22
CKB-214ENST00000555770 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
CKB-214ENST00000555770 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.64■■■■■ 5.227e-7■■■■■ 52.5
CKB-214ENST00000555770 ADAMTS12P58397 1594 aa47.59■■■■■ 5.21
CKB-214ENST00000555770 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.59■■■■■ 5.21
CKB-214ENST00000555770 NUP160Q12769 1436 aa47.55■■■■■ 5.2
CKB-214ENST00000555770 CEP170Q5SW79 1584 aa47.53■■■■■ 5.2
CKB-214ENST00000555770 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.52■■■■■ 5.2
CKB-214ENST00000555770 TOP2BQ02880 1626 aa47.51■■■■■ 5.2
CKB-214ENST00000555770 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.42■■■■■ 5.18
CKB-214ENST00000555770 SHROOM2Q13796 1616 aa47.38■■■■■ 5.17
CKB-214ENST00000555770 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.33■■■■■ 5.17
CKB-214ENST00000555770 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
CKB-214ENST00000555770 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
CKB-214ENST00000555770 JPH4Q96JJ6 628 aa47.01■■■■■ 5.12
CKB-214ENST00000555770 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.94■■■■■ 5.11
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