RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553878.5

CKB-205, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-205ENST00000553878 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.25■■■■■ 9
CKB-205ENST00000553878 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.49■■■■■ 7.75
CKB-205ENST00000553878 ABCC9O60706 1549 aa61.97■■■■■ 7.51
CKB-205ENST00000553878 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.73■■■■■ 7.15
CKB-205ENST00000553878 NACADO15069 1562 aa59.64■■■■■ 7.14
CKB-205ENST00000553878 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.41■■■■■ 7.1
CKB-205ENST00000553878 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.37■■■■■ 7.09
CKB-205ENST00000553878 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.29■■■■■ 7.08
CKB-205ENST00000553878 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.02■■■■■ 7.04
CKB-205ENST00000553878 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.38■■■■■ 6.94
CKB-205ENST00000553878 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.83■■■■■ 6.85
CKB-205ENST00000553878 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.82■■■■■ 6.85
CKB-205ENST00000553878 SCRIBQ14160 1630 aa57.81■■■■■ 6.85
CKB-205ENST00000553878 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.36■■■■■ 6.77
CKB-205ENST00000553878 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.76■■■■■ 6.68
CKB-205ENST00000553878 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.34■■■■■ 6.61
CKB-205ENST00000553878 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.12■■■■■ 6.57
CKB-205ENST00000553878 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.71■■■■■ 6.51
CKB-205ENST00000553878 SMARCA4P51532 1647 aa55.33■■■■■ 6.45
CKB-205ENST00000553878 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.28■■■■■ 6.44
CKB-205ENST00000553878 SMARCA2P51531 1590 aa55■■■■■ 6.39
CKB-205ENST00000553878 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.98■■■■■ 6.39
CKB-205ENST00000553878 NCAPD3P42695 1498 aa54.97■■■■■ 6.39
CKB-205ENST00000553878 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.87■■■■■ 6.37
CKB-205ENST00000553878 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.8■■■■■ 6.36
CKB-205ENST00000553878 HMGXB3Q12766 1538 aa54.77■■■■■ 6.36
CKB-205ENST00000553878 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.57■■■■■ 6.33
CKB-205ENST00000553878 WIZO95785 1651 aa54.31■■■■■ 6.28
CKB-205ENST00000553878 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.22■■■■■ 6.27
CKB-205ENST00000553878 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.78■■■■■ 6.2
CKB-205ENST00000553878 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.6■■■■■ 6.17
CKB-205ENST00000553878 NESP48681 1621 aa53.6■■■■■ 6.17
CKB-205ENST00000553878 ERCC6Q03468 1493 aa53.48■■■■■ 6.15
CKB-205ENST00000553878 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.35■■■■■ 6.13
CKB-205ENST00000553878 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.19■■■■■ 6.11
CKB-205ENST00000553878 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.07■■■■■ 6.09
CKB-205ENST00000553878 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.07■■■■■ 6.09
CKB-205ENST00000553878 CFTRP13569 1480 aa53.04■■■■■ 6.08
CKB-205ENST00000553878 CUX2O14529 1486 aa52.96■■■■■ 6.07
CKB-205ENST00000553878 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.89■■■■■ 6.06
CKB-205ENST00000553878 PRDM2Q13029 1718 aa52.81■■■■■ 6.04
CKB-205ENST00000553878 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.77■■■■■ 6.04
CKB-205ENST00000553878 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.76■■■■■ 6.04
CKB-205ENST00000553878 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.74■■■■■ 6.03
CKB-205ENST00000553878 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.65■■■■■ 6.02
CKB-205ENST00000553878 WDR62O43379 1518 aa52.49■■■■■ 5.99
CKB-205ENST00000553878 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.21■■■■■ 5.95
CKB-205ENST00000553878 ABCC8Q09428 1581 aa51.99■■■■■ 5.91
CKB-205ENST00000553878 TOPBP1Q92547 1522 aa51.92■■■■■ 5.9
CKB-205ENST00000553878 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.9■■■■■ 5.9
CKB-205ENST00000553878 IFT140Q96RY7 1462 aa51.62■■■■■ 5.85
CKB-205ENST00000553878 CUX1P39880 1505 aa51.49■■■■■ 5.83
CKB-205ENST00000553878 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.47■■■■■ 5.83
CKB-205ENST00000553878 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.37■■■■■ 5.81
CKB-205ENST00000553878 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.34■■■■■ 5.81
CKB-205ENST00000553878 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.31■■■■■ 5.8
CKB-205ENST00000553878 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.24■■■■■ 5.79
CKB-205ENST00000553878 SOGA1O94964 1423 aa51.23■■■■■ 5.79
CKB-205ENST00000553878 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.2■■■■■ 5.79
CKB-205ENST00000553878 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.18■■■■■ 5.78
CKB-205ENST00000553878 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.17■■■■■ 5.787e-7■■■■■ 52.5
CKB-205ENST00000553878 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.13■■■■■ 5.77
CKB-205ENST00000553878 TOP2BQ02880 1626 aa51.11■■■■■ 5.77
CKB-205ENST00000553878 WDR97A6NE52 1622 aa51.07■■■■■ 5.77
CKB-205ENST00000553878 SYNJ1O43426 1573 aa51.04■■■■■ 5.76
CKB-205ENST00000553878 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.01■■■■■ 5.761e-7■■■■□ 24.6
CKB-205ENST00000553878 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.91■■■■■ 5.74
CKB-205ENST00000553878 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.87■■■■■ 5.73
CKB-205ENST00000553878 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.69■■■■■ 5.71
CKB-205ENST00000553878 GRIN2BQ13224 1484 aa50.69■■■■■ 5.7
CKB-205ENST00000553878 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.67■■■■■ 5.7
CKB-205ENST00000553878 OSCARQ8IYS5 282 aa50.67■■■■■ 5.7
CKB-205ENST00000553878 PBRM1Q86U86 1689 aa50.65■■■■■ 5.7
CKB-205ENST00000553878 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.6■■■■■ 5.69
CKB-205ENST00000553878 CHD1O14646 1710 aa50.59■■■■■ 5.69
CKB-205ENST00000553878 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.59■■■■■ 5.69
CKB-205ENST00000553878 FBLN2P98095 1184 aa50.4■■■■■ 5.66
CKB-205ENST00000553878 SYNJ2O15056 1496 aa50.36■■■■■ 5.65
CKB-205ENST00000553878 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.29■■■■■ 5.64
CKB-205ENST00000553878 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.29■■■■■ 5.64
CKB-205ENST00000553878 ADAMTS12P58397 1594 aa50.21■■■■■ 5.63
CKB-205ENST00000553878 KIF27Q86VH2 1401 aa50.12■■■■■ 5.61
CKB-205ENST00000553878 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.1■■■■■ 5.61
CKB-205ENST00000553878 GRIN2AQ12879 1464 aa50.03■■■■■ 5.6
CKB-205ENST00000553878 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.01■■■■■ 5.6
CKB-205ENST00000553878 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.93■■■■■ 5.58
CKB-205ENST00000553878 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.93■■■■■ 5.58
CKB-205ENST00000553878 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.93■■■■■ 5.58
CKB-205ENST00000553878 ARHGEF11O15085 1522 aa49.9■■■■■ 5.58
CKB-205ENST00000553878 TRIM41Q8WV44 630 aa49.89■■■■■ 5.58
CKB-205ENST00000553878 CUL7Q14999 1698 aa49.88■■■■■ 5.58
CKB-205ENST00000553878 IGF1RP08069 1367 aa49.84■■■■■ 5.57
CKB-205ENST00000553878 NUP160Q12769 1436 aa49.8■■■■■ 5.56
CKB-205ENST00000553878 CEP170Q5SW79 1584 aa49.77■■■■■ 5.56
CKB-205ENST00000553878 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.58■■■■■ 5.53
CKB-205ENST00000553878 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.55■■■■■ 5.52
CKB-205ENST00000553878 ARAP1Q96P48 1450 aa49.48■■■■■ 5.51
CKB-205ENST00000553878 SHROOM2Q13796 1616 aa49.47■■■■■ 5.51
CKB-205ENST00000553878 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.35■■■■■ 5.49
CKB-205ENST00000553878 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.33■■■■■ 5.49
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