RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575288.5

PITPNA-207, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PITPNA, Length 1,264 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-207ENST00000575288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.03■■■■■ 8.32
PITPNA-207ENST00000575288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.69■■■■■ 7.15
PITPNA-207ENST00000575288 ABCC9O60706 1549 aa58.84■■■■■ 7.01
PITPNA-207ENST00000575288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.38■■■■■ 6.62
PITPNA-207ENST00000575288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.23■■■■■ 6.59
PITPNA-207ENST00000575288 NACADO15069 1562 aa56.21■■■■■ 6.59
PITPNA-207ENST00000575288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.75■■■■■ 6.52
PITPNA-207ENST00000575288 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.74■■■■■ 6.51
PITPNA-207ENST00000575288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.38■■■■■ 6.46
PITPNA-207ENST00000575288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.12■■■■■ 6.42
PITPNA-207ENST00000575288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.97■■■■■ 6.39
PITPNA-207ENST00000575288 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.72■■■■■ 6.35
PITPNA-207ENST00000575288 SCRIBQ14160 1630 aa54.52■■■■■ 6.32
PITPNA-207ENST00000575288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.37■■■■■ 6.29
PITPNA-207ENST00000575288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.02■■■■■ 6.24
PITPNA-207ENST00000575288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.3■■■■■ 6.12
PITPNA-207ENST00000575288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.18■■■■■ 6.1
PITPNA-207ENST00000575288 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.88■■■■■ 6.06
PITPNA-207ENST00000575288 SMARCA4P51532 1647 aa52.08■■■■■ 5.93
PITPNA-207ENST00000575288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.95■■■■■ 5.91
PITPNA-207ENST00000575288 NCAPD3P42695 1498 aa51.9■■■■■ 5.9
PITPNA-207ENST00000575288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.9■■■■■ 5.9
PITPNA-207ENST00000575288 SMARCA2P51531 1590 aa51.79■■■■■ 5.88
PITPNA-207ENST00000575288 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.69■■■■■ 5.86
PITPNA-207ENST00000575288 HMGXB3Q12766 1538 aa51.59■■■■■ 5.85
PITPNA-207ENST00000575288 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.54■■■■■ 5.84
PITPNA-207ENST00000575288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
PITPNA-207ENST00000575288 WIZO95785 1651 aa51.11■■■■■ 5.77
PITPNA-207ENST00000575288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.96■■■■■ 5.75
PITPNA-207ENST00000575288 NESP48681 1621 aa50.84■■■■■ 5.73
PITPNA-207ENST00000575288 ERCC6Q03468 1493 aa50.71■■■■■ 5.71
PITPNA-207ENST00000575288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.56■■■■■ 5.68
PITPNA-207ENST00000575288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
PITPNA-207ENST00000575288 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.39■■■■■ 5.66
PITPNA-207ENST00000575288 CUX2O14529 1486 aa50.27■■■■■ 5.64
PITPNA-207ENST00000575288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.26■■■■■ 5.64
PITPNA-207ENST00000575288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.18■■■■■ 5.62
PITPNA-207ENST00000575288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.09■■■■■ 5.61
PITPNA-207ENST00000575288 CFTRP13569 1480 aa50.01■■■■■ 5.6
PITPNA-207ENST00000575288 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.95■■■■■ 5.59
PITPNA-207ENST00000575288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.82■■■■■ 5.57
PITPNA-207ENST00000575288 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.78■■■■■ 5.56
PITPNA-207ENST00000575288 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.77■■■■■ 5.56
PITPNA-207ENST00000575288 WDR62O43379 1518 aa49.61■■■■■ 5.53
PITPNA-207ENST00000575288 PRDM2Q13029 1718 aa49.56■■■■■ 5.52
PITPNA-207ENST00000575288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
PITPNA-207ENST00000575288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
PITPNA-207ENST00000575288 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.18■■■■■ 5.46
PITPNA-207ENST00000575288 TOPBP1Q92547 1522 aa48.99■■■■■ 5.43
PITPNA-207ENST00000575288 ABCC8Q09428 1581 aa48.9■■■■■ 5.42
PITPNA-207ENST00000575288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.88■■■■■ 5.42
PITPNA-207ENST00000575288 IFT140Q96RY7 1462 aa48.74■■■■■ 5.39
PITPNA-207ENST00000575288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.61■■■■■ 5.37
PITPNA-207ENST00000575288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
PITPNA-207ENST00000575288 CUX1P39880 1505 aa48.5■■■■■ 5.35
PITPNA-207ENST00000575288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
PITPNA-207ENST00000575288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.39■■■■■ 5.34
PITPNA-207ENST00000575288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.38■■■■■ 5.34
PITPNA-207ENST00000575288 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.36■■■■■ 5.33
PITPNA-207ENST00000575288 SOGA1O94964 1423 aa48.35■■■■■ 5.33
PITPNA-207ENST00000575288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.29■■■■■ 5.32
PITPNA-207ENST00000575288 OSCARQ8IYS5 282 aa48.16■■■■■ 5.3
PITPNA-207ENST00000575288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
PITPNA-207ENST00000575288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.05■■■■■ 5.284e-6■■■■□ 21.5
PITPNA-207ENST00000575288 WDR97A6NE52 1622 aa47.99■■■■■ 5.27
PITPNA-207ENST00000575288 SYNJ1O43426 1573 aa47.97■■■■■ 5.27
PITPNA-207ENST00000575288 TOP2BQ02880 1626 aa47.96■■■■■ 5.27
PITPNA-207ENST00000575288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.95■■■■■ 5.27
PITPNA-207ENST00000575288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.87■■■■■ 5.25
PITPNA-207ENST00000575288 CHD1O14646 1710 aa47.82■■■■■ 5.25
PITPNA-207ENST00000575288 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.81■■■■■ 5.24
PITPNA-207ENST00000575288 GRIN2BQ13224 1484 aa47.8■■■■■ 5.24
PITPNA-207ENST00000575288 FBLN2P98095 1184 aa47.8■■■■■ 5.24
PITPNA-207ENST00000575288 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.78■■■■■ 5.24
PITPNA-207ENST00000575288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.72■■■■■ 5.23
PITPNA-207ENST00000575288 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.7■■■■■ 5.23
PITPNA-207ENST00000575288 PBRM1Q86U86 1689 aa47.67■■■■■ 5.22
PITPNA-207ENST00000575288 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
PITPNA-207ENST00000575288 SYNJ2O15056 1496 aa47.53■■■■■ 5.2
PITPNA-207ENST00000575288 TRIM41Q8WV44 630 aa47.47■■■■■ 5.19
PITPNA-207ENST00000575288 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.43■■■■■ 5.18
PITPNA-207ENST00000575288 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.43■■■■■ 5.18
PITPNA-207ENST00000575288 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.43■■■■■ 5.18
PITPNA-207ENST00000575288 ARHGEF11O15085 1522 aa47.38■■■■■ 5.18
PITPNA-207ENST00000575288 ADAMTS12P58397 1594 aa47.29■■■■■ 5.16
PITPNA-207ENST00000575288 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.29■■■■■ 5.16
PITPNA-207ENST00000575288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.28■■■■■ 5.16
PITPNA-207ENST00000575288 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.2■■■■■ 5.15
PITPNA-207ENST00000575288 GRIN2AQ12879 1464 aa47.2■■■■■ 5.15
PITPNA-207ENST00000575288 KIF27Q86VH2 1401 aa47.05■■■■■ 5.12
PITPNA-207ENST00000575288 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47■■■■■ 5.11
PITPNA-207ENST00000575288 ARAP1Q96P48 1450 aa47■■■■■ 5.11
PITPNA-207ENST00000575288 CEP170Q5SW79 1584 aa46.99■■■■■ 5.11
PITPNA-207ENST00000575288 NUP160Q12769 1436 aa46.99■■■■■ 5.11
PITPNA-207ENST00000575288 IGF1RP08069 1367 aa46.94■■■■■ 5.1
PITPNA-207ENST00000575288 CUL7Q14999 1698 aa46.78■■■■■ 5.08
PITPNA-207ENST00000575288 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.67■■■■■ 5.06
PITPNA-207ENST00000575288 SHROOM2Q13796 1616 aa46.67■■■■■ 5.06
PITPNA-207ENST00000575288 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.65■■■■■ 5.06
PITPNA-207ENST00000575288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.6■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms