Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRAK4Q9NWZ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRAK4Q9NWZ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRAK4Q9NWZ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRAK4Q9NWZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRAK4Q9NWZ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRAK4Q9NWZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRAK4Q9NWZ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRAK4Q9NWZ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms