Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARVAQ9NVD7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARVAQ9NVD7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARVAQ9NVD7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARVAQ9NVD7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARVAQ9NVD7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARVAQ9NVD7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARVAQ9NVD7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARVAQ9NVD7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARVAQ9NVD7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARVAQ9NVD7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARVAQ9NVD7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARVAQ9NVD7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARVAQ9NVD7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARVAQ9NVD7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PARVAQ9NVD7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARVAQ9NVD7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARVAQ9NVD7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PARVAQ9NVD7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARVAQ9NVD7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARVAQ9NVD7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARVAQ9NVD7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARVAQ9NVD7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARVAQ9NVD7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARVAQ9NVD7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms