Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD18Q9NS91 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD18Q9NS91 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD18Q9NS91 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD18Q9NS91 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD18Q9NS91 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD18Q9NS91 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD18Q9NS91 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD18Q9NS91 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD18Q9NS91 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD18Q9NS91 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD18Q9NS91 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD18Q9NS91 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD18Q9NS91 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms