Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FZD3Q9NPG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FZD3Q9NPG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FZD3Q9NPG1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FZD3Q9NPG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FZD3Q9NPG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD3Q9NPG1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FZD3Q9NPG1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FZD3Q9NPG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms