Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CD248Q9HCU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD248Q9HCU0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD248Q9HCU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD248Q9HCU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD248Q9HCU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD248Q9HCU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CD248Q9HCU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CD248Q9HCU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD248Q9HCU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms