Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4F12Q9HCS2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP4F12Q9HCS2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4F12Q9HCS2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4F12Q9HCS2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4F12Q9HCS2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP4F12Q9HCS2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP4F12Q9HCS2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4F12Q9HCS2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4F12Q9HCS2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms