Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCI7

MSL2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL2Q9HCI7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL2Q9HCI7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSL2Q9HCI7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL2Q9HCI7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSL2Q9HCI7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL2Q9HCI7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL2Q9HCI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL2Q9HCI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSL2Q9HCI7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSL2Q9HCI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL2Q9HCI7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL2Q9HCI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL2Q9HCI7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms