Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBL6

LRTM1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM1Q9HBL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRTM1Q9HBL6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRTM1Q9HBL6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRTM1Q9HBL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRTM1Q9HBL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRTM1Q9HBL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRTM1Q9HBL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRTM1Q9HBL6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms