Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM27Q9HBJ8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM27Q9HBJ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM27Q9HBJ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM27Q9HBJ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM27Q9HBJ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM27Q9HBJ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM27Q9HBJ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM27Q9HBJ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms