Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EBF3Q9H4W6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EBF3Q9H4W6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EBF3Q9H4W6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF3Q9H4W6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF3Q9H4W6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EBF3Q9H4W6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EBF3Q9H4W6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EBF3Q9H4W6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF3Q9H4W6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EBF3Q9H4W6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF3Q9H4W6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms