Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Z9

TSPAN10, Tetraspanin-10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN10Q9H1Z9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN10Q9H1Z9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN10Q9H1Z9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN10Q9H1Z9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN10Q9H1Z9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN10Q9H1Z9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN10Q9H1Z9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN10Q9H1Z9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN10Q9H1Z9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms