Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MUC3BQ9H195 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MUC3BQ9H195 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MUC3BQ9H195 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MUC3BQ9H195 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MUC3BQ9H195 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MUC3BQ9H195 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MUC3BQ9H195 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MUC3BQ9H195 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MUC3BQ9H195 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC3BQ9H195 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms