Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH19Q9H159 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH19Q9H159 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH19Q9H159 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH19Q9H159 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH19Q9H159 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH19Q9H159 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH19Q9H159 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH19Q9H159 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms