Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD2

SLC29A3, Equilibrative nucleoside transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A3Q9BZD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC29A3Q9BZD2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC29A3Q9BZD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC29A3Q9BZD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC29A3Q9BZD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC29A3Q9BZD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC29A3Q9BZD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC29A3Q9BZD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC29A3Q9BZD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC29A3Q9BZD2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC29A3Q9BZD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC29A3Q9BZD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC29A3Q9BZD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC29A3Q9BZD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC29A3Q9BZD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC29A3Q9BZD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC29A3Q9BZD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms