Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF8Q9BRL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF8Q9BRL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF8Q9BRL6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF8Q9BRL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF8Q9BRL6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF8Q9BRL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF8Q9BRL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF8Q9BRL6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms