Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GORASP1Q9BQQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GORASP1Q9BQQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GORASP1Q9BQQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GORASP1Q9BQQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GORASP1Q9BQQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GORASP1Q9BQQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GORASP1Q9BQQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GORASP1Q9BQQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GORASP1Q9BQQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GORASP1Q9BQQ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GORASP1Q9BQQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GORASP1Q9BQQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GORASP1Q9BQQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GORASP1Q9BQQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GORASP1Q9BQQ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GORASP1Q9BQQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms