Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RETNLBQ9BQ08 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RETNLBQ9BQ08 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RETNLBQ9BQ08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RETNLBQ9BQ08 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms