Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF6BQ99941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF6BQ99941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF6BQ99941 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF6BQ99941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6BQ99941 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF6BQ99941 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6BQ99941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms