Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABRG3Q99928 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRG3Q99928 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRG3Q99928 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABRG3Q99928 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRG3Q99928 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRG3Q99928 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GABRG3Q99928 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GABRG3Q99928 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRG3Q99928 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRG3Q99928 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GABRG3Q99928 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GABRG3Q99928 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRG3Q99928 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRG3Q99928 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABRG3Q99928 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRG3Q99928 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRG3Q99928 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GABRG3Q99928 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRG3Q99928 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRG3Q99928 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRG3Q99928 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRG3Q99928 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRG3Q99928 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms