Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms