Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TEFMQ96QE5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TEFMQ96QE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TEFMQ96QE5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TEFMQ96QE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TEFMQ96QE5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TEFMQ96QE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TEFMQ96QE5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TEFMQ96QE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms