Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG3

TTC25, Tetratricopeptide repeat protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC25Q96NG3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC25Q96NG3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TTC25Q96NG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC25Q96NG3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC25Q96NG3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC25Q96NG3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC25Q96NG3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC25Q96NG3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC25Q96NG3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC25Q96NG3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC25Q96NG3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC25Q96NG3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC25Q96NG3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC25Q96NG3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms