Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM56Q96MV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM56Q96MV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM56Q96MV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM56Q96MV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM56Q96MV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM56Q96MV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM56Q96MV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms