Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf72Q96LT7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf72Q96LT7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf72Q96LT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9orf72Q96LT7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf72Q96LT7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9orf72Q96LT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf72Q96LT7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf72Q96LT7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf72Q96LT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9orf72Q96LT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf72Q96LT7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf72Q96LT7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf72Q96LT7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms