Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NEURL4Q96JN8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEURL4Q96JN8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEURL4Q96JN8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NEURL4Q96JN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NEURL4Q96JN8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NEURL4Q96JN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEURL4Q96JN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEURL4Q96JN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEURL4Q96JN8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEURL4Q96JN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NEURL4Q96JN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NEURL4Q96JN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
NEURL4Q96JN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
NEURL4Q96JN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NEURL4Q96JN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEURL4Q96JN8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NEURL4Q96JN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NEURL4Q96JN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEURL4Q96JN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NEURL4Q96JN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
NEURL4Q96JN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
NEURL4Q96JN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NEURL4Q96JN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NEURL4Q96JN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
NEURL4Q96JN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NEURL4Q96JN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NEURL4Q96JN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NEURL4Q96JN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NEURL4Q96JN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NEURL4Q96JN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NEURL4Q96JN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NEURL4Q96JN8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NEURL4Q96JN8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NEURL4Q96JN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms