Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCORQ96JN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCORQ96JN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCORQ96JN0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCORQ96JN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LCORQ96JN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LCORQ96JN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCORQ96JN0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCORQ96JN0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCORQ96JN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCORQ96JN0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCORQ96JN0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCORQ96JN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCORQ96JN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCORQ96JN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms