Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM5Q96HS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM5Q96HS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM5Q96HS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM5Q96HS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM5Q96HS1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM5Q96HS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM5Q96HS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM5Q96HS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM5Q96HS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM5Q96HS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM5Q96HS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms