Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRELD1Q96HD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRELD1Q96HD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRELD1Q96HD1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRELD1Q96HD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRELD1Q96HD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CRELD1Q96HD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRELD1Q96HD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CRELD1Q96HD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRELD1Q96HD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRELD1Q96HD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRELD1Q96HD1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRELD1Q96HD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRELD1Q96HD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms