Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
BCANQ96GW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
BCANQ96GW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
BCANQ96GW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
BCANQ96GW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
BCANQ96GW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
BCANQ96GW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
BCANQ96GW7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
BCANQ96GW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
BCANQ96GW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
BCANQ96GW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
BCANQ96GW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
BCANQ96GW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
BCANQ96GW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
BCANQ96GW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
BCANQ96GW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.52■■■■□ 3.92
BCANQ96GW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
BCANQ96GW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.43■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.4■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
BCANQ96GW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BCANQ96GW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
BCANQ96GW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BCANQ96GW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BCANQ96GW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
BCANQ96GW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
BCANQ96GW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
BCANQ96GW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BCANQ96GW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BCANQ96GW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
BCANQ96GW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
BCANQ96GW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
BCANQ96GW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
BCANQ96GW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
BCANQ96GW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
BCANQ96GW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.95■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
BCANQ96GW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
BCANQ96GW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms