Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC46Q96FV0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC46Q96FV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC46Q96FV0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC46Q96FV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC46Q96FV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC46Q96FV0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC46Q96FV0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms