Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC51Q96ER9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC51Q96ER9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC51Q96ER9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC51Q96ER9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC51Q96ER9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC51Q96ER9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC51Q96ER9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC51Q96ER9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC51Q96ER9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC51Q96ER9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms