Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEH1LQ96EE3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEH1LQ96EE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEH1LQ96EE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEH1LQ96EE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEH1LQ96EE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEH1LQ96EE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms