Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAMF9Q96A28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLAMF9Q96A28 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLAMF9Q96A28 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLAMF9Q96A28 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLAMF9Q96A28 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAMF9Q96A28 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms