Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTSSAQ969W0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTSSAQ969W0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTSSAQ969W0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTSSAQ969W0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTSSAQ969W0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTSSAQ969W0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTSSAQ969W0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTSSAQ969W0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTSSAQ969W0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTSSAQ969W0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTSSAQ969W0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTSSAQ969W0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTSSAQ969W0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTSSAQ969W0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms