Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GJA10Q969M2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA10Q969M2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJA10Q969M2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJA10Q969M2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GJA10Q969M2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJA10Q969M2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA10Q969M2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA10Q969M2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms