Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
GJA10Q969M2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GJA10Q969M2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GJA10Q969M2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
GJA10Q969M2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GJA10Q969M2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GJA10Q969M2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GJA10Q969M2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GJA10Q969M2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GJA10Q969M2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GJA10Q969M2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GJA10Q969M2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GJA10Q969M2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GJA10Q969M2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GJA10Q969M2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GJA10Q969M2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GJA10Q969M2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GJA10Q969M2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GJA10Q969M2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GJA10Q969M2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GJA10Q969M2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GJA10Q969M2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GJA10Q969M2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJA10Q969M2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GJA10Q969M2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJA10Q969M2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GJA10Q969M2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GJA10Q969M2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJA10Q969M2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJA10Q969M2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GJA10Q969M2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GJA10Q969M2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJA10Q969M2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJA10Q969M2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GJA10Q969M2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GJA10Q969M2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GJA10Q969M2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GJA10Q969M2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GJA10Q969M2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GJA10Q969M2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GJA10Q969M2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GJA10Q969M2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GJA10Q969M2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GJA10Q969M2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJA10Q969M2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GJA10Q969M2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GJA10Q969M2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJA10Q969M2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GJA10Q969M2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
GJA10Q969M2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJA10Q969M2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJA10Q969M2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GJA10Q969M2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJA10Q969M2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GJA10Q969M2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GJA10Q969M2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GJA10Q969M2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GJA10Q969M2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJA10Q969M2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GJA10Q969M2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GJA10Q969M2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GJA10Q969M2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GJA10Q969M2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJA10Q969M2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GJA10Q969M2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GJA10Q969M2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJA10Q969M2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GJA10Q969M2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
GJA10Q969M2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GJA10Q969M2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GJA10Q969M2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GJA10Q969M2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GJA10Q969M2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GJA10Q969M2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GJA10Q969M2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GJA10Q969M2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GJA10Q969M2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GJA10Q969M2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GJA10Q969M2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GJA10Q969M2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA10Q969M2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA10Q969M2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJA10Q969M2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GJA10Q969M2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJA10Q969M2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJA10Q969M2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJA10Q969M2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GJA10Q969M2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GJA10Q969M2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJA10Q969M2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJA10Q969M2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJA10Q969M2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GJA10Q969M2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJA10Q969M2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJA10Q969M2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJA10Q969M2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJA10Q969M2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJA10Q969M2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GJA10Q969M2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GJA10Q969M2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms