Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF34Q969K3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF34Q969K3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF34Q969K3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF34Q969K3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF34Q969K3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF34Q969K3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF34Q969K3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF34Q969K3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF34Q969K3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF34Q969K3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF34Q969K3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF34Q969K3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms