Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF7Q92985 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF7Q92985 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF7Q92985 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF7Q92985 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF7Q92985 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRF7Q92985 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF7Q92985 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF7Q92985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF7Q92985 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRF7Q92985 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF7Q92985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms