Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EDEM1Q92611 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDEM1Q92611 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDEM1Q92611 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDEM1Q92611 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDEM1Q92611 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM1Q92611 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDEM1Q92611 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDEM1Q92611 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDEM1Q92611 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM1Q92611 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM1Q92611 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EDEM1Q92611 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms