Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCG3Q8WXD2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SCG3Q8WXD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCG3Q8WXD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG3Q8WXD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG3Q8WXD2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCG3Q8WXD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCG3Q8WXD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCG3Q8WXD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCG3Q8WXD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCG3Q8WXD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG3Q8WXD2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG3Q8WXD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms