Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX33Q8WV41 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX33Q8WV41 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX33Q8WV41 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX33Q8WV41 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX33Q8WV41 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX33Q8WV41 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX33Q8WV41 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms